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案例分析

经典的克隆载体和TOPO载体的对比

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拓扑异构酶简介 
–TOPO克隆载体利用了DNA拓扑异构酶I,加快了PCR克隆 。拓扑异构酶I在位点CCCTT切断并松弛超螺旋DNA,然后重新连接末端。这样,其同时作为限制酶和连接酶。  
TOPO克隆原理 

TOPO克隆是一种将拓扑异构酶与 T- 载体相结合的 PCR 产物快速克隆系统 pCR-TOPO ,无需 DNA 连接酶做连接。牛痘(Vaccinia) 病毒拓扑异构酶 Ⅰ 可以结合在双链 DNA 的特异位点上,并可在一条链上于 5’-CCCTT 序列之后打开磷酸二酯键(cleave the phosphodiester backbone),释放出的能量可催化 DNA 切口处的 3' 磷酸基团与拓扑异构酶 的第 274 位的酪氨酸(Tyr)残基共价结合,同样这个共价键又会受到切口处 5' 羟基的攻击,进行可逆反应,恢复切口处磷酸二酯键,重新将 DNA 连接起来。 pCR-TOPO 载体就是根据拓扑异构酶 Ⅰ 的这一性质来开发的, pCR-TOPO 载体也是一种 T 载体,只是在其 3'末端的突出 T 上共价结合了一个拓扑异构酶 Ⅰ ,当带 3' 末端的突出 A 的 PCR 产物与该 T 载体互补配对时,拓扑异构酶 Ⅰ 就将该缺口连接起来。